少女芳江（木口亚矢饰）本是某艺妓馆内的低等侍女，她潜心伺候身为当家艺妓的姐姐菊奴（长谷部瞳饰），但是菊奴对她颐指气使，绝情绝义。偶然机会，芳江过人的膂力被影野制铁的少爷影野光（斋藤工饰）所发掘。影野制铁表面上是一家大型家族式钢铁公司，暗中则受命于国家，担负武器的制造工作。与此同时，其创始人影野拳山（志垣太郎饰）怀有不可告人的野心，他四处网罗人生失意的女孩，将她们训练成美貌与杀伤力并重的艺妓杀手，甚至通过身体机械化改造来加强女孩们的实力。懵懵懂懂的芳江与菊奴被骗进入影野制铁，姐妹俩更被迫互相残杀。在此过程中，她们为了超越对方而不断加强训练和改造，继而成为影野家族不可或缺的机器人杀手。然而随着任务的进行，芳江却渐渐发现亲情的珍贵以及影野家族的丑恶用心……

“瞧一瞧看一看，暗芝居表演开始喽~”伴随着稀疏冷清的鼓声，江湖艺人（津田宽治配音）鬼魅的吆喝声再度响起，充满好奇心的孩子从四面八方聚过来，一同观看哪一个有一个让人胆战心惊并且回味起来已经冷汗直冒的恐怖故事。承接第一季，《暗芝居》的故事继续以洋片（紙芝居）的表现形式讲述短小精悍的恐怖故事，而此次制作阵容得到壮大，在恐怖领域占有重要席位的清水崇（《咒怨》）、井口升（《无限富江》）等导演相继加盟，无疑提升了本作第二季的恐怖指数。片尾曲方面，初音带来的《四十九日目》，其邪典气息不逊于前作。此外，官网依然不定期提供恐怖短篇小说，让爱好者们继续在幽暗的世界里徜徉。