该剧讲述了高智商、高学历的化学工程师吕云鹏，因亲情触发，只身前往西南边陲，在禁毒干警的保驾护航下，潜伏进入黑暗艰险的贩毒网络之中，与形形色色的毒贩斗智斗勇，一路追查幕后黑手，直捣金三角贩毒集团楚门的核心，经历九死一生，最终配合警方将楚门连根拔起，成为一名功勋卧底的故事。

刑警队长陈飞（孙红雷饰）从警多年，这次抓捕重犯杜刚招致配合抓捕的钢厂李未成（李强饰）总经理受伤，加之老搭档胡建国遭人刺杀，使陈飞陷入自责苦闷之中。由于怕因痛失好友的陈飞情绪失控，局长将胡建国被杀案交给了新来的重案组长。陈飞不满局长的决定，他决定单枪匹马、只身虎穴调查此案，以告慰战友天上亡灵。种种迹象把怀疑的目光投向了钢厂李未成，而面对步步紧逼的陈飞，李未成剑走偏锋，买通医生纪雪菲（董晓燕饰）诬陈飞患有精神疾病。陈飞依靠苏兆龙（王奎荣饰）暗中支持逼迫李未成交待了自已的罪行，并反水倒戈供出了幕后操纵者——钢厂董事长何静宜（王馥荔饰）……

副市长聂大海之子、天都市龙腾集团董事长、闻名全省的青年企业家，这些都是加诸在聂明宇（陈道明饰）身上的称呼。但他最重要的身份则是天都市最大的地下黑社会的头目。平日里一表人才、斯文有礼的聂明宇实则道貌岸然。他利用其四通发达的人际网，收买海关人员，走私货物，牟取暴利。而他的左右手也能力非凡，手段毒辣。在他们的经营下，龙腾集团的业绩步步高升。但世上没有不透风的墙。一封匿名检举信被递到了省委组织部。聂明宇及龙腾集团的勾当引起了省委方面的高度警觉，责令天都市迅速查明原因。但聂明宇的势力早已覆盖整个天都市。市委把聂明宇的义兄，刑警队队长刘振汉（陶泽如饰）安排调查此事，想继续掩盖聂明宇的罪恶事迹。一场关于亲情和正义的较量在刘振汉身上展开。邪与正的角逐，究竟谁胜谁负？