江户时代，天下太平，只有人性之恶在蠢蠢欲动。岩本虎眼（加藤精三配音）是被称为“绝世剑士”的优秀剑客，他的道场也成为了天下习剑之人梦寐以求的圣地。在道场中，有两个人的名字不得不提，一个是自幼被虎眼捡来抚养成人的藤木源之助（浪川大辅配音），同时，他也是最有希望成为道场继承人的人选。另一个，则是半路杀出的伊良子清玄（佐佐木望配音），虽然他的资历尚浅，但其优越的武术才能使他成为了源之助的强劲对手，虎眼的女儿岩本三重（桑岛法子）亦对他有着深深的爱慕。这时，一个邪恶的命令被传达了，本来应使用木剑进行的御前比试，被改为了使用真剑。只要能在御前比试中夺得头筹，即可享有无上的荣耀。本来就暗中较劲的藤木源之助和伊良子清玄，他们之间血与肉的厮杀即将展开。

凪宗一郎（保志总一朗配音）和卜比牧原（三木真一郎配音）的到来让本来平静的统道学园鸡犬不宁。虽然统道学园是一所武校，但学校提倡平和理智的武道，反对无因的暴力，而宗一郎和牧原两人此次的目的却是征服这座学校。结果可想而知，宗一郎被前来的柔剑部部长枣真夜（久川绫配音）及高柳雅孝（关智一配音）一脚踢飞，倒霉的他掉入了刚洗完澡的枣亚夜（茅原实里配音）身上，没想到枣亚夜对他一见钟情。于是，有着女性恐惧症的宗一郎在统道学园的快乐生活开始了。而随着校园生活的推进，一些被称为“柱”的标志逐渐浮出水面，这些标志分别刻在谁的上？又代表了什么？宗一郎决定一探究竟。