故事发生在位于关东南部的川神市，春天来临，万物复苏，平凡的少年直江大和（神谷浩史配音）来到了川神学园，准备在这里开始全新的校园生活。刚刚开学，校园里是一副欣欣向荣的热闹景象，在这里，大和会遇见怎样有趣的伙伴，又会发生怎样有趣的故事呢？活泼开朗，古灵精怪的川神百代（浅川悠配音）、四肢发达，头脑简单的川神一子（友永朱音配音）、温文尔雅，温柔大方的黛由纪江（后藤邑子配音）、外冷内热，坚强韧性的椎名京（冰青配音），心高气傲，绝不认输的克丽丝蒂安妮·弗里德里希（伊藤静配音），围绕在大和身边的，正是这些性格迥异但同样善良正直的美少女们。

动画的故事舞台设定在现代的涩谷之中。主角织田龙平在小学时目击过憧憬的哥哥的神秘死亡现场。现在是高中生的他，早已摆脱了当时的恶梦。和平常一样练着拳击的某天晚上，他被奇怪的生物咬了一口，坠入了一个和平常不同的梦。

随同去年9月底《超时空要塞F》最终回放送结束之际，TV动画片尾便登布了剧场版制作的消息，广大死忠为之虎躯一震，翘首以待。在2009年1月发售的Macross系列作品的综合杂志《MacrossAce》Vol.001当中，些许剧场版情报流出，其中在河森正治总监督＆菅野洋子特别会谈中，两位业内人士对将在2009年上映的《超时空要塞MF》剧场版进行了将近3小时的对话，从中我们得知了剧场版将计划让库兰往爱情方面发展，补足TV中的遗憾，原本在TV中河森神棍的许多建议未被采纳的建议今回将在剧场版中表现出来，而剧中也许会对TV系列进行回顾，引用河森的说法便是为了能让初次接触MF的人对该作有个大概的了解，所以在角色的立场上会有所变动，而至于库兰是否顶替双歌姬的位置菅野洋子回答有机会的话会尝试。在忙碌于剧场版制作将近半年的时间内，6月份发售的《MacrossAce》Vol.002终于闪亮登场，同时还带来了两则关于剧场版的消息。其一为剧场版《超时空要塞F》将于11月21日正式上映，加入了冬季剧场放映档期。其二为剧场版《超时空要塞F》标题正式定为“虚空歌姫”，而杂志图中绿坝娘兰华李惊现真实二字，腹黑状态的雪露女王只搭配了嘘字，难不成在剧场版中将要揭示绿坝娘才是阿尔特的最终翅膀么！？那么之前《MacrossAce》Vol.001中透露的库兰为主角又是怎么回事！？河森神棍你必须给我们一个交代啊！河森你有什么不开心的事？说出来让大家开心一下，请不要黑雪露好吗？

というわけで「荒川ＵＢ」第２期製作決定です！！！皆様、荒川河川敷の仲間達を引き続き宜しくお願いいたします！

阳光明媚的一天，盛大的B级美食嘉年华在春日部市召开，野原新之助（矢岛晶子配音）看到新闻后兴奋非常，于是和樱田妮妮、风间彻、代全林、佐藤正男等好朋友们商定，偷偷前往嘉年华大饱口福。与此同时，B级美食嘉年华举行的消息也传到所谓的A级美食机构。该机构最高负责人满美食大人（中村悠一配音）对B级食物充满鄙夷，他决定彻底摧毁这些下等吃食。未久，A级美食的飞船飞临嘉年华，对底层料理手艺人进行无情驱逐。为了挽救B级美食，炒面阿健决定启用传承已达五十代的秘制酱汁。阿健的相好红子走投无路，将酱汁罐子交给春日部防卫队的各位。小新和朋友们无意间承担起包围B级美食的重任……

故事发生在一间名为达利亚学园的寄宿学校之中，这所学校矗立在孤岛之上，绝非外人轻易能够抵达。达利亚学园分为两派——东和国派与西众公国派，实际上，这两个国家之间正在进行战争，因此，两国的学生就读在同一所学院之中，气氛可谓是十分的紧张。东和国的学生与西众公国的学生都有着他们专属的公寓，而犬冢露壬雄（小野友树配音）和朱丽叶（茅野爱衣配音）分别是两个国家学生之中的两名领袖人物。然而所有人都不知道的是，这两个人表面身份敌对剑拔弩张，实际上却是秘密恋爱的地下情侣，这一层关系一旦被别人知道，整个学校就将陷入混乱之中。

美术大学学生竹本和学长真山以及多次留级的森田一起生活在单身公寓里，大家的生活风清云淡却也乐趣无穷。他们的老师花本先生向三人介绍了自己表兄的女儿，阿久。外表幼小的阿久有着惊人的艺术表现力，竹本和森田都不觉得对她一见钟情。难以言表的爱情、友情在三人之间渐渐弥漫。另一方面，真山爱上了花本老师的朋友理花小姐，而理花却深陷对逝世丈夫的怀念，难以自拔。和真山青梅竹马的山田，在坚强爽朗的个性下却常常因为对真山的单恋而独自落泪。那个夏季，空气里弥漫着甜蜜也氤氲着苦涩，四叶草在风中摇曳，等待幸福的孩子们采摘。

讲述高墙内的人类们为了自己的生存对抗巨人的故事。

美术大学五人组的故事仍在继续。竹本（神谷浩史配音）结束了寻找自我的单车之旅，在盛放烟火的晚上对阿久（工藤晴香配音）说出了那句“我喜欢你。”山田（高桥美佳子配音）依旧陷在单恋真山（杉田智和配音）的泥沼中，野宫（滨田贤二配音）的出现成了泥沼里一株逃脱的稻草；真山则继续追寻着理花（大原沙耶香配音），胜利的曙光在不远处；森田（上田佑司配音）和阿久，两个天才的兮兮相惜，能否换来最后的相守。时间在四季轮回中流逝，微小的变化一点点积攒成为不可忽视的转折点。五人都面临着新的人生，各奔东西。已逝去的奇迹般的岁月，并不会消失，而成为永久的回忆，在内心转动。改编自同名漫画的《蜂蜜与四叶草》故事也走向终点，但对于他们，这则是新的起点。

大财团公子哥市之宫行（神谷浩史配音）自由不知愁滋味，俨然叼着金汤匙出生的金贵少爷，就读于名门学府T大的他即将毕业，未来的人生一片光明，令人欣羡。他铭记市之宫家的家训“不求人，不欠人”，并以此为傲。可是现实的残酷却不得不令他拖欠人情，在开车通过荒川河时，他被几名少年抢走名贵跑车，裤子也被强行扒下挂在桥顶。强逞英雄的阿行爬桥不慎跌落水中，危急时刻被附近的少女小珊（坂本真绫配音）救助。拖欠了人情的阿行答应作小珊的恋人，他极不情愿地随着这个自称金星人的少女留在荒川河床，并解释了在此生活的一对电波系怪人：河童村长、星星、武士、修女、铁人兄弟等。有趣怪诞的故事就此展开……本片根据中村光的同名漫画改编。

著名的大文豪在那个夜晚，与他心爱的人来到玉川上水。为了亲自了结他"可耻的生涯"。然而在此同时，那台惯例的卡车突然出现… 这位作家来到异世界，按道理应该获得特殊的"神授之力"，结果他的状态列居然是前所未有的劣等。 "你没有在这里活下去的才能，甚至没有那个资格！" 在异世界也同样失格的作家，他崭新的冒险故事，在这里开幕。

双叶翔太郎（土屋神叶配音）是一名刚刚升上高中的校园新鲜人，初三那年夏天，因为被苍高男子艺术体操社的表演所吸引，翔太郎选择考入这所学校，并且加入了体操社，在这里，他结识了一群志同道合的伙伴们。具备高超的实力但总是拒人于千里之外的美里良夜（石川界人配音）、温柔可靠，课余兴趣是栽培盆栽的副社长筑馆敬助（近藤隆配音）、社里唯一的正常人女川长吉（下野纮配音）、外表看上去有点吓人但性格十分细腻善良的亘理光太郎（神谷浩史配音），和这些可靠的前辈们在一起训练，翔太郎虽然对艺术体操一无所知，但凭借着自己的天赋和努力的汗水，他迅速的成长着。